厦门市非常重视“科技兴海”工作，每年厦门市级财政直接投入海洋科技项目研究的经费均在1000万元以上，有力确保了“科技兴海”项目的开展。

该市海洋与渔业局组织的“治疗骨关节炎的特效药物葡糖胺硫酸盐制备中试研究”通过验收和鉴定，并获得厦门市重大科技进步三等奖。同时该局还组织了“海洋生物特异功能基因药物”，“鱼类下脚料胶原蛋白研制”、章鱼“天然牛黄酸提取生产工艺”等研究都取得一定进展，其中“天然牛黄酸提取生产工艺”获得2006年厦门市重大科技进步三等奖。